GSE211115

小鼠睾丸发育图谱

本图谱覆盖小鼠出生后多个发育时间点的睾丸单细胞转录组,用于观察首轮精子发生及睾丸体细胞环境的变化。数据来源为 GSE211115,提供生殖细胞、支持细胞、间质细胞、肌样细胞和其他主要细胞群的表达与注释信息。

GEO 编号
GSE211115
物种
Mus musculus
组织
睾丸
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
66,442
样本
9
基因数
27,998
细胞元数据字段
2

图谱示意预览

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图注:组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱覆盖小鼠出生后多个发育时间点的睾丸单细胞转录组,用于观察首轮精子发生及睾丸体细胞环境的变化。数据来源为 GSE211115,提供生殖细胞、支持细胞、间质细胞、肌样细胞和其他主要细胞群的表达与注释信息。

包含出生后 3、6、8、11、14、17、21、25 天及 5 周的 9 份样本。与小鼠生殖细胞谱系图谱同源。

关联文献

[1]

Zhao L, Zhao Y, Yao C, Dai Y, Li Z, Tang Y. MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease. Andrology. 2023;11(6):1157-1162. doi: 10.1111/andr.13402. PMID: 36710661.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE211115

NCBI GEO GSE211115

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 AAACCTGGTGTGCGTC_4 0.104 -14.025 SPG
2 AACGTTGCAGCTGCAC_7 8.491 1.736 SPT
3 CTCGGGAAGCCAGAAC_6 5.907 -3.801 EC
4 TCGTAGATCCAAGCCG_3 -5.987 10.033 PTM
5 TTTGTCACAGACGCCT_3 1.574 -0.527 SC