GSE117403 / GSE141445

人前列腺正常与肿瘤图谱

本图谱整合正常前列腺与前列腺肿瘤的单细胞转录组，展示腔面、基底、分泌相关上皮细胞和间质、免疫细胞。正常组织与肿瘤来自不同研究，适合浏览细胞表达特征；跨来源的差异还需考虑研究批次及样本构成。

GEO 编号
GSE117403 / GSE141445
物种
Homo sapiens
组织
前列腺
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
16,893
来源分组
16
基因数
33,694
细胞元数据字段
3

图谱示意预览

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图注：组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱整合正常前列腺与前列腺肿瘤的单细胞转录组，展示腔面、基底、分泌相关上皮细胞和间质、免疫细胞。正常组织与肿瘤来自不同研究，适合浏览细胞表达特征；跨来源的差异还需考虑研究批次及样本构成。

正常部分含 3 个来源分组，肿瘤部分保留 13 个来源后缀，共 16 个来源分组。来源分组不直接等同于独立供体；Normal 8,892、PC 8,001 个细胞。

关联文献

[1]

Henry GH, Malewska A, Joseph DB, Malladi VS, Lee J, Torrealba J, et al. A Cellular Anatomy of the Normal Adult Human Prostate and Prostatic Urethra. Cell Rep. 2018;25(12):3530-3542.e5. doi: 10.1016/j.celrep.2018.11.086. PMID: 30566875.

PubMed ↗ · DOI ↗

[2]

Chen S, Zhu G, Yang Y, Wang F, Xiao YT, Zhang N, et al. Single-cell analysis reveals transcriptomic remodellings in distinct cell types that contribute to human prostate cancer progression. Nat Cell Biol. 2021;23(1):87-98. doi: 10.1038/s41556-020-00613-6. PMID: 33420488.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE117403 / GSE141445

NCBI GEO GSE117403 / GSE141445

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞，用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 CTTACCGAGTGCGTGA-4_1 9.028 6.384 FB
2 TAGACCACATCCGTGG-2_2 -6.194 3.474 LE
3 TAAGTGCCAGGAATGC-3_3 -3.180 -6.830 KRT13+OE
4 AGCGTCGTCTAACTCT.11 -6.375 0.859 LE
5 ACTGTCCTCCGTAGTA.8 -3.722 -1.054 SCGB1A1+OE