GSE145443

小鼠附睾与输精管图谱

本图谱覆盖小鼠附睾头、体、尾和输精管，展示主细胞的区域差异以及透明细胞、基底细胞和间质、免疫等支持细胞。可用于查询精子在附睾成熟及输送过程中相关细胞群的表达特征。

GEO 编号
GSE145443
物种
Mus musculus
组织
附睾与输精管
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
8,880
区域文库
4
基因数
16,892
细胞元数据字段
3

图谱示意预览

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图注：组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱覆盖小鼠附睾头、体、尾和输精管，展示主细胞的区域差异以及透明细胞、基底细胞和间质、免疫等支持细胞。可用于查询精子在附睾成熟及输送过程中相关细胞群的表达特征。

4 只成年雄性小鼠的组织按 Caput、Corpus、Cauda、Vasdef 混池，形成 4 个区域文库；文库不等于独立生物学重复。

关联文献

[1]

Rinaldi VD, Donnard E, Gellatly K, Rasmussen M, Kucukural A, Yukselen O, et al. An atlas of cell types in the mouse epididymis and vas deferens. Elife. 2020;9:e55474. doi: 10.7554/eLife.55474. PMID: 32729827.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE145443

NCBI GEO GSE145443

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞，用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 Caput___AGGGAGTTCATGTAGC 5.398 -18.684 Narrow
2 Cauda___CCTAGCTAGACACTAA 1.684 -1.448 Principal
3 Corpus___TAGGCATTCGTCACGG -12.043 -4.262 Stromal
4 Vasdef___CGGACACTCGGAGCAA -2.034 11.533 Stromal
5 Vasdef___TTCGGTCCAACTGGCC -0.521 12.526 Stromal