GSE149512

人生殖细胞谱系图谱

本图谱从人睾丸正常发育数据中提取生殖细胞,描述精原细胞、精母细胞到精子细胞的转录状态。细分注释支持观察精子发生过程中的阶段性表达变化;本图谱与人睾丸发育图谱共享来源,不能作为独立受试者队列重复计数。

GEO 编号
GSE149512
物种
Homo sapiens
组织
睾丸
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
22,777
样本
10
基因数
59,976
细胞元数据字段
3

图谱示意预览

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图注:组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱从人睾丸正常发育数据中提取生殖细胞,描述精原细胞、精母细胞到精子细胞的转录状态。细分注释支持观察精子发生过程中的阶段性表达变化;本图谱与人睾丸发育图谱共享来源,不能作为独立受试者队列重复计数。

来自人睾丸正常发育队列,含 14 个细分群及 4 个较粗层级注释;与发育图谱不是独立队列。

注释说明

LZ009:5 岁;LZ005:8 岁。

关联文献

[1]

Zhao L, Yao C, Xing X, Jing T, Li P, Zhu Z, et al. Single-cell analysis of developing and azoospermia human testicles reveals central role of Sertoli cells. Nat Commun. 2020;11(1):5683. doi: 10.1038/s41467-020-19414-4. PMID: 33173058.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE149512

NCBI GEO GSE149512

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 AACCGCGAGCGACGTA_1 6.296 4.595 SSC1
2 CTACATTCAGCCCACA_3 -0.913 6.691 Z.SPC
3 566947_7 -10.104 -2.871 SPC7
4 CCTACCAGTTCGAATC_1 4.819 -7.508 SPT3
5 465813_9 5.825 -0.955 SPT4