GSE168545
大鼠阴茎海绵体衰老图谱
本图谱展示年轻与老龄大鼠阴茎海绵体的单细胞转录状态,包含成纤维细胞及其增殖群、平滑肌细胞、内皮细胞、脂肪细胞和免疫细胞。对应研究关注海绵体衰老及年龄相关勃起功能障碍,特别是成纤维细胞异质性和衰老相关变化。
图谱示意预览
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本图谱展示年轻与老龄大鼠阴茎海绵体的单细胞转录状态,包含成纤维细胞及其增殖群、平滑肌细胞、内皮细胞、脂肪细胞和免疫细胞。对应研究关注海绵体衰老及年龄相关勃起功能障碍,特别是成纤维细胞异质性和衰老相关变化。
当前图谱为 7,134 个细胞的子集,含 Young、Old 两组。原研究使用 5 只年轻及 5 只老年大鼠;当前对象未保留可核对的供体字段。
数据结构
- 可用嵌入
- X_umap, X_tsne
- 默认着色
- cell_type
- 细胞元数据字段
- 12
- 细胞元数据字段
- nCount_RNA, nFeature_RNA, age, RNA_snn_res.0.8, seurat_clusters, RNA_snn_res.0.5, integrated_snn_res.0.5, integrated_snn_res.0.8, integrated_snn_res.1, integrated_snn_res.1.5, cell_type, cell_type2
数据统计
—样本
7,134细胞数
22,050基因数
7细胞类型数
关联文献
数据预览
以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。
| 序号 | 细胞 ID | UMAP 1 | UMAP 2 | 细胞分组 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ATCGCCTTCTAGTCAG-2 | 2.627 | -3.418 | FB |
| 2 | GCGGATCCAATGGCCC-2 | -4.007 | -1.178 | FB |
| 3 | CTACGGGTCAAGCCTA-1 | -2.589 | 4.047 | VSMC |
| 4 | GAGACTTGTTACGATC-1 | 0.215 | 1.404 | CCSMC |
| 5 | TACGCTCAGACGCAGT-1 | 1.943 | 5.532 | FB.pro |
