GSE168545

大鼠阴茎海绵体衰老图谱

本图谱展示年轻与老龄大鼠阴茎海绵体的单细胞转录状态,包含成纤维细胞及其增殖群、平滑肌细胞、内皮细胞、脂肪细胞和免疫细胞。对应研究关注海绵体衰老及年龄相关勃起功能障碍,特别是成纤维细胞异质性和衰老相关变化。

GEO 编号
GSE168545
物种
Rattus norvegicus
组织
阴茎海绵体
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
7,134
样本
—
基因数
22,050
细胞元数据字段
12

图谱示意预览

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图注:组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱展示年轻与老龄大鼠阴茎海绵体的单细胞转录状态,包含成纤维细胞及其增殖群、平滑肌细胞、内皮细胞、脂肪细胞和免疫细胞。对应研究关注海绵体衰老及年龄相关勃起功能障碍,特别是成纤维细胞异质性和衰老相关变化。

当前图谱为 7,134 个细胞的子集,含 Young、Old 两组。原研究使用 5 只年轻及 5 只老年大鼠;当前对象未保留可核对的供体字段。

关联文献

[1]

Liu Q, Song Y, Cui Y, Hu C, Luo Y, Hu D, et al. Heterogeneity of fibroblasts is a hallmark of age-associated erectile dysfunction. Int J Biochem Cell Biol. 2023;156:106343. doi: 10.1016/j.biocel.2022.106343. PMID: 36503049.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE168545

NCBI GEO GSE168545

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 ATCGCCTTCTAGTCAG-2 2.627 -3.418 FB
2 GCGGATCCAATGGCCC-2 -4.007 -1.178 FB
3 CTACGGGTCAAGCCTA-1 -2.589 4.047 VSMC
4 GAGACTTGTTACGATC-1 0.215 1.404 CCSMC
5 TACGCTCAGACGCAGT-1 1.943 5.532 FB.pro