GSE182786

人睾丸衰老图谱

本图谱比较年轻与老年人睾丸的单细胞转录组，并展示老年组按 BMI 相关表型划分的亚组。原研究分析生殖细胞与体细胞的衰老变化及其与较高 BMI 的关联，可用于查询不同细胞群的年龄相关表达模式。

GEO 编号
GSE182786
物种
Homo sapiens
组织
睾丸
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
42,035
样本
12
基因数
36,601
细胞元数据字段
5

UMAP 预览

点击图片放大查看
图注：UMAP 预览按细胞注释着色；完整交互与筛选请进入可视化页面。

数据说明

本图谱比较年轻与老年人睾丸的单细胞转录组，并展示老年组按 BMI 相关表型划分的亚组。原研究分析生殖细胞与体细胞的衰老变化及其与较高 BMI 的关联，可用于查询不同细胞群的年龄相关表达模式。

4 位年轻供体、5 位 LowBMI_Old 供体、3 位 HighBMI_Old 供体。当前细胞分别为 12,427、18,928、10,680 个。

关联文献

[1]

Nie X, Munyoki SK, Sukhwani M, Schmid N, Missel A, Emery BR, et al. Single-cell analysis of human testis aging and correlation with elevated body mass index. Dev Cell. 2022;57(9):1160-1176.e5. doi: 10.1016/j.devcel.2022.04.004. PMID: 35504286.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE182786

NCBI GEO GSE182786

查看 GEO 记录 ↗

数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞，用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 Young1.AAACCCAGTCATCCCT.1 -10.735 -3.492 SPC7
2 Young4.GCCATGGCAGTTAAAG.1 -6.164 -14.286 SSC2
3 Older4.GATCAGTAGCCGGAAT.1 -9.198 4.079 SPT2
4 Older6.GATCAGTAGCATGATA.1 -6.659 5.714 SPT2
5 Older8.TTTGTTGGTATGGAAT.1 11.713 9.807 VSM