GSE211115
小鼠生殖细胞谱系图谱
本图谱是 GSE211115 小鼠睾丸发育数据的生殖细胞部分,覆盖精原细胞分化、减数分裂及精子细胞形成。细分群保留原对象的阶段标签,便于比较精子发生过程中的表达变化,并与完整睾丸发育图谱联合浏览。
图谱示意预览
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本图谱是 GSE211115 小鼠睾丸发育数据的生殖细胞部分,覆盖精原细胞分化、减数分裂及精子细胞形成。细分群保留原对象的阶段标签,便于比较精子发生过程中的表达变化,并与完整睾丸发育图谱联合浏览。
来自小鼠睾丸发育队列,含 18 个细分群及 4 个较粗层级注释;细胞与发育图谱重叠。
数据结构
- 可用嵌入
- X_umap
- 默认着色
- cell_type
- 细胞元数据字段
- 4
- 细胞元数据字段
- seurat_clusters, age, cell_type2, cell_type
数据统计
9样本
25,802细胞数
27,998基因数
18细胞类型数
关联文献
数据预览
以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。
| 序号 | 细胞 ID | UMAP 1 | UMAP 2 | 细胞分组 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | TGTGTTTTCTGATACG_4 | -7.705 | 13.206 | SSC1 |
| 2 | CATCAAGCAAAGCGGT_7 | -9.169 | -7.812 | Pl |
| 3 | TGGTTAGCAGTTTACG_7 | 1.992 | 0.123 | RS2 |
| 4 | GTGCATAGTTCGAATC_7 | 6.745 | 0.801 | RS4 |
| 5 | CTTCTCTTCTCAAACG_8 | 5.917 | -8.939 | E |
