GSE211115

小鼠生殖细胞谱系图谱

本图谱是 GSE211115 小鼠睾丸发育数据的生殖细胞部分,覆盖精原细胞分化、减数分裂及精子细胞形成。细分群保留原对象的阶段标签,便于比较精子发生过程中的表达变化,并与完整睾丸发育图谱联合浏览。

GEO 编号
GSE211115
物种
Mus musculus
组织
睾丸
测序类型
Single-cell RNA-seq
细胞数
25,802
样本
9
基因数
27,998
细胞元数据字段
4

图谱示意预览

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图注:组织与细胞组成示意图。

数据说明

本图谱是 GSE211115 小鼠睾丸发育数据的生殖细胞部分,覆盖精原细胞分化、减数分裂及精子细胞形成。细分群保留原对象的阶段标签,便于比较精子发生过程中的表达变化,并与完整睾丸发育图谱联合浏览。

来自小鼠睾丸发育队列,含 18 个细分群及 4 个较粗层级注释;细胞与发育图谱重叠。

关联文献

[1]

Zhao L, Zhao Y, Yao C, Dai Y, Li Z, Tang Y. MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease. Andrology. 2023;11(6):1157-1162. doi: 10.1111/andr.13402. PMID: 36710661.

PubMed ↗ · DOI ↗

数据来源GSE211115

NCBI GEO GSE211115

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数据预览

以下为确定性抽样的 5 个细胞,用于快速检查数据结构。

序号 细胞 ID UMAP 1 UMAP 2 细胞分组
1 TGTGTTTTCTGATACG_4 -7.705 13.206 SSC1
2 CATCAAGCAAAGCGGT_7 -9.169 -7.812 Pl
3 TGGTTAGCAGTTTACG_7 1.992 0.123 RS2
4 GTGCATAGTTCGAATC_7 6.745 0.801 RS4
5 CTTCTCTTCTCAAACG_8 5.917 -8.939 E